مارک ویلموتس اولین بازی ملیاش را برای تیم ملی فوتبال بلژیک در تاریخ ۲۶ مه ۱۹۹۰ میلادی مقابل تیم ملی فوتبال رومانی انجام داد. او در ۷۰ بازی ملی حضور داشت و جمعاً ۴۹۴۷ دقیقه برای تیم ملی فوتبال بلژیک به میدان رفت. مارک ویلموتس آخرین بازی ملی خود را در تاریخ ۱۷ ژوئن ۲۰۰۲ میلادی در برابر تیم ملی فوتبال برزیل انجام داد. وی در بازیهای ملیاش ۲۹ گل به ثمر رساند.
مارک ویلموتس تاکنون برای تیم های شالکه ۰۴ (موقت), سنت ترویدنس, بلژیک , ساحل عاج مربی گری کرده است و میتوان گفت ایران پنجمین تجربه مربیگری حرفه ای مارک ویلموتس است.